Những lợi ích của chiến lược sản xuất chỉ trong thời gian (JIT) được ghi lại rõ ràng, nhưng nó cũng có thể có một số nhược điểm nghiêm trọng. Vấn đề chính với quy trình sản xuất này được chứng minh bằng tên của nó. "Vừa đúng lúc" có nghĩa là sự thành công của chiến lược kinh doanh này phụ thuộc phần lớn vào sự phối hợp chính xác giữa các doanh nghiệp và nhà cung cấp của họ để đảm bảo giao hàng nhanh chóng. Do không có bộ đệm hàng tồn kho, doanh nghiệp có thể bị ảnh hưởng rất lớn nếu bất kỳ một yếu tố sản xuất nào bị trì hoãn.
Chiến lược sản xuất JIT có nghĩa là các doanh nghiệp không sản xuất các mặt hàng để bán cho đến khi họ được khách hàng đặt hàng, có nghĩa là hàng tồn kho thấp hoặc không có. Mặc dù hàng tồn kho thấp có thể có lợi cho lợi nhuận của công ty theo một số cách, nhưng điều hành một doanh nghiệp theo cách này đòi hỏi rất nhiều sự phối hợp. Từ việc có được các nguyên liệu thô cần thiết cho sản xuất đến đảm bảo giao hàng kịp thời, mọi khía cạnh của sản xuất JIT phải được đồng bộ hóa. Điều này thường có nghĩa là các doanh nghiệp phải đầu tư vào việc triển khai công nghệ thông tin để cho phép thông báo tự động cho nhà cung cấp khi nhận được đơn đặt hàng.
Theo mô hình sản xuất dựa trên hàng tồn kho tiêu chuẩn, các doanh nghiệp đặt hàng lớn cho nguyên liệu từ các nhà bán buôn và nhiều mặt hàng có thể được sản xuất từ một lô hàng. Khi sản xuất cạn kiệt lô hàng nguyên liệu đầu tiên, một đơn hàng khác được chuyển đi, tạo ra một bộ đệm thời gian thuận tiện. Sản xuất theo yêu cầu có nghĩa là các công ty phải tìm nhà cung cấp sẵn sàng thực hiện các đơn đặt hàng nhỏ, thường xuyên trong một thông báo rất ngắn, điều này thường có nghĩa là sử dụng các nhà cung cấp địa phương để giảm thời gian vận chuyển và chi phí. Không có hàng tồn kho hoặc nguyên vật liệu, bất kỳ vấn đề nào về chuỗi cung ứng có thể dẫn đến sự chậm trễ giao hàng và khiến khách hàng tức giận. Giá hàng thô tăng đột ngột do các vấn đề về tìm nguồn cung ứng nguyên liệu, thiếu hụt, thiên tai hoặc biến động chính trị (gọi là sốc cung) cũng có thể là mối đe dọa nghiêm trọng đối với khả năng phục vụ khách hàng của công ty một cách hiệu quả.
Bởi vì sản xuất JIT hoàn toàn dựa trên các đơn đặt hàng hiện tại, nó không phải là hệ thống hiệu quả nhất để xử lý các vấn đề bất ngờ. Một công ty sử dụng chiến lược này có thể không được trang bị đầy đủ để xử lý nhu cầu sản phẩm tăng đột ngột. Việc thiếu hàng tồn kho dự phòng có nghĩa là khách hàng phải đợi công ty nhận vật tư và sản xuất sản phẩm. Điều này có thể có nghĩa là sự chậm trễ kéo dài, khách hàng không hài lòng và có khả năng bị mất một phần của tất cả các đơn đặt hàng nếu có bất kỳ vấn đề nào về chuỗi cung ứng phát sinh.
Không có khả năng thực hiện các đơn đặt hàng lớn một cách kịp thời có thể tiêu tốn một khoản tiền kinh doanh, nhưng có những chi phí ẩn khác vốn có trong chiến lược JIT cũng quan trọng không kém, mặc dù ít kịch tính hơn. Sản xuất hàng hóa để bán với số lượng nhỏ hơn có nghĩa là chi tiêu ít hơn cho mỗi lô hàng nguyên liệu thô, nhưng nó thực sự có thể khiến một công ty tốn kém hơn. Các doanh nghiệp có mức sản xuất cao được hưởng lợi từ quy mô kinh tế: khi sản xuất tăng, chi phí sản xuất trung bình của mỗi mặt hàng thực sự giảm. Điều này một phần là do mua hàng bán buôn lớn thường đi kèm với giảm giá dựa trên số lượng hào phóng. Các doanh nghiệp sử dụng chiến lược sản xuất JIT có thể trả nhiều tiền hơn cho mỗi mặt hàng vì họ phải thực hiện các đơn hàng nhỏ hơn, thường xuyên hơn không đủ điều kiện cho các loại phá vỡ giá này. Các chi phí vận chuyển và giao hàng bổ sung đi kèm với việc đặt hàng thường xuyên hơn cũng có thể có tác động quan trọng đến lợi nhuận, cũng như môi trường.
